Constituée en 2012, l’équipe de recherche de l'ESTA est une équipe pluridisciplinaire dont les projets de recherche trouvent leur source dans la double compétence proposée par l’école et se développent sur deux thématiques complémentaires : Ingénierie et Management.
Les travaux de l'équipe de recherche s'articulent autour de l'axe hybride suivant : « Développement de connaissances, de méthodes et d'outils pour la conception de produits, systèmes et services centrés sur l'humain et respectueux de l'environnement ».
La recherche à l'ESTA se veut principalement de nature applicative avec une valeur ajoutée directe pour les entreprises. Les travaux de l'équipe visent à améliorer la performance économique des entreprises dans le respect des engagements sociaux et sociétaux.
Afin de conduire des activités de recherche innovantes dans des domaines d'expertise de pointe, chaque enseignant-chercheur est associé à un laboratoire de recherche reconnu : ELLIADD-ERCOS (UR 4661), FEMTO-ST (UMR 6174), CRJFC (EA 3225), LIMA (UMR 7042).
L’ESTA, consciente des enjeux importants, a donné des moyens conséquents à son équipe de recherche pour lui permettre de mieux produire et de rayonner ainsi sur un plan national, voire international. La "Convention partenariat" signée en janvier 2019 avec la COMUE de l’UBFC facilite les échanges et la mutualisation des activités de recherche.
Par ailleurs, depuis décembre 2024, l'ESTA est membre associé de l'Université Marie et Louis Pasteur (UMLP). L'UMLP se veut un acteur clé dans le paysage académique national et international, s'appuyant sur les forces de ses composantes et de ses partenaires pour répondre aux ambitions de la région et pour relever les défis d'un environnement académique et scientifique en constante évolution. L'UMLP est issue de l'évolution de l'université de Franche-Comté et de la ComUE UBFC. L'UMLP s'inscrit dans la structuration territoriale pour optimiser la politique de site en Bourgogne-Franche-Comté. En partenariat avec l'EPE Bourgogne-Europe, l'UMLP joue un rôle crucial dans la mise en œuvre des stratégies régionales de l'enseignement supérieur et la recherche. Cette coopération permet de mutualiser les moyens, coordonner les actions et maximiser l'impact des initiatives locales sur la scène nationale et internationale. L'UMLP vise à promouvoir l'excellence académique et scientifique, à améliorer la lisibilité et l'attractivité de ses formations et de ses projets de recherche et à renforcer sa visibilité internationale. L'Université Marie et Louis Pasteur se positionne comme un acteur majeur de l'enseignement supérieur et de la recherche en France, avec une ambition d'excellence, de rayonnement international.